Старший преподаватель кафедры «Математические и естественнонаучные дисциплины»
Senior lecturer of the Department «Mathematical and Natural Sciences»
К.т.н., доцент, профессор кафедры «Математические и естественнонаучные дисциплины»
Candidate of Tech-nical Sciences, Associate Professor, Professor of the Department of «Mathematical and Natural Sciences»
В статье изучаются процессы образования моделей при взаимодействии молекул очистителя и загрязнителя на примере сероводорода и аспарагина, подчеркивается важность компьютерного моделирования в разработке эффективных методов очистки. Молекулярное взаимодействие между аспарагином и сероводородом исследуется с использованием полуэмпирического метода PM3. Целью работы было выявление в структуре аспарагина активных атомов, с которыми могут взаимодействовать молекулы сероводорода, приводя к формированию соединений с достаточной прочностью. Исследования проводились с использованием квантово-химических вычислений оптимизированных по энергии структур отдельных молекул и их взаимодействий. Поиск минимума полной энергии проводился по всем независимым геометрическим параметрам в процессе полной оптимизации геометрии молекулы. Приведены результаты расчетов основных зарядовых, энергетических и геометрических параметров. Представлена схема активных атомов молекулы аспарагина по отношению к сероводороду, полученная на основе проведенных квантово-химических исследований. Использованные правила позволили среди множества смоделированных адсорбционных комплексов выявить реально существующие. Полученные данные предоставляют новые перспективы для понимания последствий этого взаимодействия в контексте медицинских и экологических исследований.
The article examines the processes of model formation in the interaction of cleaner and pollutant molecules using the example of hydrogen sulfide and asparagine, and emphasizes the importance of computer modeling in the development of effective cleaning methods. The study is aimed at the molecular interaction between asparagine and hydrogen sulfide, conducted using the semi-empirical PM3 method. The aim of the study was to identify active atoms in the structure of asparagine, with which hydrogen sulfide molecules can interact, leading to the formation of compounds with sufficient strength. The research was carried out using quantum chemical calculations of energy-optimized structures of individual molecules and their interactions. The search for the minimum total energy was carried out for all independent geometric parameters in the process of complete optimization of the geometry of the molecule. The results of calculations of the main charge, energy and geometric parameters are presented. The scheme of the active atoms of the asparagine molecule in relation to hydrogen sulfide, obtained on the basis of quantum chemical studies, is presented. The rules used made it possible to identify real-life adsorption complexes among the many simulated ones. The findings provide new perspectives for understanding the implications of this interaction in the context of medical and environmental research.
The authors declare that there are no conflicts of interest present.